Если шифруется весь раздел скажем ну 100 гб сколько это занимает времени?
В первую очередь скорость шифрования зависит от скорости работы диска. Время может быть очень и очень различно. Как из-за разного железа, так и из-за доступных в программе настроек по скорости шифрования. В среднем это может занять 1,5-2 часа.
Но не следует забывать что в AES (Rijndael) есть больше но т.к одинаковым блокам 128 данных однозначно соотвествует зашифрованный блок данных. Тоесть сохраняются статистические свойства открытого текста. В связи с этим у меня вопрос- реализуется ли в программе предварительное архивирование данных для избежания недостатка алгоритма?
Не совсем понятно, что Вы имеете в виду. В Secure Disk не производится никакого архивирования данных. Используется режим сцепления блоков (СВС).
Но реализуется ли дополнительная развертка ключа?
Ключ генерируется с учетом паролей и случайных данных. Не ясно о каком недостатке Вы говорите.
Как решена проблема преобразования блока данных хвоста?
Опять же совсем не понятно, что именно Вы имеете в виду. Хвостов у нас нет